伴重症肌无力的胸腺瘤分子概型：胸腺瘤患者伴重症肌无力的危险因素分析
目的
胸腺瘤是一种罕见的上皮肿瘤，起源于前纵隔的胸腺。近50%的胸腺瘤患者会发展为重症肌无力，伴有重症肌无力的患者长期预后不佳。这里，我们确定了特异性和有效的分子标记物，用于预测患有胸腺瘤的患者重症肌无力的发展情况。
材料与方法
我们研究了基于RNA测序(RNA-seq)的分子分析，用于胸腺瘤患者重症肌无力的发展。从34名胸腺瘤患者中提取RNA，其中16名患有肌无力，18名无肌无力，并通过二代测序分析转录组谱。
结果
我们在胸腺瘤患者中发现了个与重症肌无力相关的差异表达基因。缺氧诱导因子3α(HIF3A)、胰岛素样生长因子结合蛋白1（IGFBP1）、丙酮酸脱氢酶激酶（PDK4）和Krüppel样因子15（KLF15）四个基因在患有重症肌无力的胸腺瘤患者中差异表达，并通过定量验证聚合酶链反应。重症肌无力患者的HIF3A表达显着高于非重症肌无力患者。
结论
HIF3A在患有重症肌无力的胸腺瘤患者中异常表达，并且可能参与了胸腺瘤患者重症肌无力的发展。
样本患者的基本情况
RNA差异表达结果，A和B是对个基因进行主成分分析后的两个基因簇（PC1和PC2）结果展示
A：按是否有重症肌无力展示PC1和PC2的情况
B：按胸腺瘤分型展示PC1和PC2的情况
C：个高变异基因的表达谱
然后以log2foldchange2和P0.05进行基因筛选（此处可以有个火山图的）筛选出个差异表达基因，其中个上调，4个下调，分成20个基因簇，其中只有10个有统计学意义
A展示了这个基因的表达谱
B用DAVID进行10个基因簇的功能分析，这些基因在伴重症肌无力的胸腺瘤中可能与铁离子结合、Fos转构蛋白、基膜、细胞连接等等相关。
进一步筛选了4个基因：缺氧诱导因子3α(HIF3A)、胰岛素样生长因子结合蛋白1（IGFBP1）、丙酮酸脱氢酶激酶（PDK4）和Krüppel样因子15（KLF15），下图是用另外一个独立的样本（14个7个MG和7个非MG）Q-PCR结果，可见四个基因在MG患者相比非MG患者都是高表达的。
然后用ROC曲线检验一下分子预测效能
A用的Ctvalue（cyclethresholdvalue）
B用的Q-PCR的readcounts
最后再用WB和免疫组化验证一下
总而言之，以上研究表明HIF3A和IGFBP1在患有重症肌无力的胸腺瘤患者中异常表达，是胸腺瘤患者伴发重症肌无力的危险因素，并且可能参与了胸腺瘤患者重症肌无力的发展。
顺带一提，HIF的相关研究曾获得了年的诺贝尔生理学或医学奖
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