《庆余年》故事大背景
在我们这个世界时间线几十或者一百年以后，地球东亚某国遭到了来路不明的核弹袭击，引发了全球范围的核大战。那些有核弹的国家互相投掷，没有核弹的国家造出核弹投掷，反正就是地球范围内的核礼花，最后把整个地球炸成了核冬天，进入了生物大灭绝时期。
这个小说在连载初期胆子是很大的，用很不晦涩的方式提到了核弹爆发点是东亚某国，后来越来越火影响越来越大，这个设定就被删掉了。但后来依然保留了“大东山下曾经有个超级繁华的大都市，也是第一个承受核弹袭击的城市，最后把半座山都炸成了手机屏幕那么光滑”这个剧情，从场景描述来看，大概也能知道说的是什么地方。
由于地球核辐射超标，所有生物都无法生存，于是幸存的人类乘坐宇宙飞船去了外星。当然也有一部分有情怀的人类选择留了下来，准备跟地球共存亡。这些人用地球剩下的资源在世界各地建立了若干座军事博物馆，将人类大部分文明产物样品（书籍、武器、工具、交通工具等）保留在了里面，还留下了一台超级电脑，以及大量旧人类的记忆数据在电脑里，而维护博物馆的工作则交给一些仿生机器人。
旧人类最终在时光流逝中彻底灭亡，但他们希望某年某月某一天文明重启，新生人类能够找到这些博物馆，然后重新缅怀这段逝去的悲惨文明。
地球经过几十万年的演变，地貌环境彻底改变，但辐射值依然居高不下，而散布在各地的军事博物馆也只剩下北极的一座。
地球上的物种开启了另一种进化模式，那就是跟核辐射共存，新生的人类就拥有这样的能力。但当时的地球出现了很多变异的巨兽，新生人类无法与之匹敌。于是北极军事博物馆的电脑派遣机器人帮助人类战胜大自然，建立文明秩序。
新生人类将那些机器人称之为“使者”，并将这些机器人的主人也就是超级电脑称之为“神庙”，还建立了配套的信仰系统。
这台超级电脑在新人类的不断供奉下，产生了一种超越人类的自我意识，它真的将自己当成了神，并且自主开启了所谓的“神庙四定律”，对人类社会进行全方位操控跟引导。
在各地建立了神庙分部，由苦修士和祭司管理，随时向北极神庙总部汇报沟通，还在人类中选取超强天赋的人到神庙接受知识跟技能培训，然后回到人类世界执行任务，这些人被称为“天脉者”。
神庙认为封建时代是最安全，也最符合人类整体利益的，所以它扶持起了一个大魏国政权，在大陆上统治了上千年。
神庙认为一直让生产力停留在农耕时代，人类就不会再次点亮跟核武器相关的黑科技，然后再次爆发世界大战并毁灭文明。于是神庙封锁了人类所有科技力量，将那些可能引发科技大爆炸的人类天才进行抹杀。
为了避免人类在争斗中，将热兵器再次研发出来，神庙对人类中一部分特种个体进行研究分析，发现这些人体内有一种可以吸纳核辐射能量的新器官。而这些人利用新器官吸入核辐射能量后，不但能够强化自身体质，还能将其发射出去，制造跟热武器一样的杀伤力。
于是神庙将这些特种人类称之为“武者”，将可以吸收核辐射的新器官称为经脉，将核辐射能量称为“真气”或者“天地元气”，还将武者分为1~9个品级。拥有了一套完整的修炼符方式，以及配套的升级系统，人类不再去研发热兵器，国家之间的军事对决也变成了武者实力大PK。
神庙对人类武者各个流派以及武技种类进行数据采集，通过上千年的时间运算筛选，最终得出了三个方向的终极成果，编成了三本终极秘籍。一旦人类武者练成了这三本秘籍，则可以变成跟过去核武器一样的恐怖存在。
正因为这些秘籍违反了神庙四定律，于是神庙将其作为最高机密进行封锁，禁止任何使者跟天脉者将其泄露出去。
叶轻眉时代开启
由于神庙的自身老化，神庙使者不断的报废消耗，再加上人类天脉者不停的背叛。神庙终于决定开启了最后的记忆工程计划，就是用新人类的婴儿肉体，注入旧人类的记忆数据，生成具有旧人类思维的新款天脉者，代替神庙统治世界。
但这个实验刚开始就失败了，第一个实验体叶轻眉，在意识觉醒之后直接反水神庙，不但偷走了三本最高机密的秘籍，还在军事博物馆偷走了一把巴雷特狙击枪，若干子弹跟药丸，还有一些科技制品的技术图纸。
最可恨的一点，叶轻眉还把为数不多的神庙使者拐走了一个，而且还是战斗力最强的瞎子五竹。有了这些神装备以后，叶轻眉开始了改造世界的宏大计划。
第一步，造四大宗师。大魏国苦荷跟肖恩来北极寻找神庙，无意中撞到了神庙逃亡的叶轻眉，并将其带离神庙。叶轻眉作为回报，将三大秘籍之一的天一道功法送给苦荷，苦荷拿回去修炼后，成为世界第一个大宗师。
跟苦荷肖恩告别以后，叶轻眉回到神庙带走五竹和装着巴雷特的黑箱子，来到东夷城做生意。期间认识了东夷城城主的白痴少爷，叶轻眉将三大秘籍之一的无名剑谱送给少爷，少爷练成后自灭满门，成为第二个大宗师四顾剑。
之后叶轻眉来到南庆国，在儋州偶遇了诚王世子、落魄贵族范建、诚王府小太监陈五常，四人一见如故并且准备去南庆国做一番大事业。叶轻眉将最后一本《无名功决》上下册送给诚王世子，后来世子成功破境，成为可以无限容纳真气的王道大宗师庆帝。
在叶轻眉离开儋州，去京都访友的时候，被守备师长叶重刁难，叶轻眉跟五竹吊打了叶重。叶重的叔叔叶流云找五竹单挑，被吊打后回到道场练习掌法，而且模仿五竹用黑布蒙上双眼，最终练成流云散手，成为武道大宗师。
自此，天下四大宗师集齐，大魏国统治大陆的时代也彻底终结，改成了苦荷坐镇北齐、四顾剑镇守东夷城、叶流云庆帝盘踞南庆的三足鼎立之势。
第二步，将南庆国向现代国家进行改革。叶轻眉用巴雷特暗杀了两个南庆国皇子，扶持最没有地位的老三诚王上位。作为回报，诚王一族刚开始全力支持叶轻眉的所有改革措施。
在南庆国建立三大坊，成立水军开通海外通商渠道，壮大了叶家商号，将玻璃、香皂等超时代的产物推广到世界各地，聚拢了大量财富，也让南庆壮大了国力。
兴建水利发展农业，开通水路交通，建立了覆盖全国的邮政系统，扩大信息渠道跟沟通速度。印发报纸等现代媒体，让老百姓知道官僚跟皇族的信息，开启民智的同时，也有一定的舆论监督作用。
成立监察院，由原来的小太监陈五常（改名为陈萍萍）担任院长，监察院的最高宗旨就是监督皇权，不让皇帝变成手握天下大权的权力机器。
叶轻眉的一系列改革引发了皇族跟高层，甚至诚王一家的不满。本来是叶轻眉拥趸的庆帝也产生了杀心，他趁叶轻眉临盆身体最为虚弱之际，将范建带离京都随驾西征，陈萍萍北上防御北齐，将叶重调去定州，把京都防卫权全部交给秦家掌控。再通过庆庙大祭司勾结神庙，派出神庙使者将五竹引出太平别院。
这时候一直憎恨叶轻眉的皇后太后一族提着菜刀杀进无人防卫的太平别院，将叶轻眉杀死。万幸范建在临走前做了周密部署，用自己的亲生儿子给叶轻眉的儿子顶包，等到五竹回来救下叶轻眉之子，开启了《庆余年》正篇的故事。
范闲时代的正篇故事
范闲跟叶轻眉一样，是记忆工程的实验体，只不过范闲的本体是二十一世纪重症肌无力患者范慎的记忆数据，在叶轻眉怀孕并生产后，会在婴儿大脑内自动激活。
范闲醒来后已经被送到了儋州，喜提范建私生子的身份，在范府猥琐成长，跟若干个丫鬟都关系暧昧，其中最漂亮的思思后来被范闲收为了妾室，还生下了女儿范小花。
武功方面，范闲练习了五竹从皇宫带走的《无名功决》，但只练了上班册霸道，这也为后来几次爆体做了铺垫。后来监察院三处主办费介受陈萍萍委托，来儋州调教范闲，范闲学会了最重要的保命技能——制毒和制药，而且水平之高直接跻身世界三大毒宗师之一。
范闲成年以后被召唤进入京都，主角光环开始大放异彩。
京都中跟范闲有关联的三拨人：第一拨是叶轻眉的旧势力，陈萍萍范建为首，陈萍萍掌握着监察院，打算让范闲接班，在范闲四岁的时候，费介就已经将提司腰牌给了他。这个提司是权力极大，几乎跟院长评级的存在，监察院当年第一任提司就是五竹。养父范建则希望范闲远离宫廷斗争，全身心经营叶轻眉留下的内库（叶家商号被庆帝接收后改成内库，由长公主李云睿掌管），做一个衣食无忧的富家翁，过快乐而奢华糜烂的生活。
第二拨是想杀死范闲的势力，以长公主李云睿为主。李云睿不但是内库的掌控人，而且是范闲未来老婆林婉儿的亲生母亲，也等于是范闲的丈母娘。长公主对范闲多次下杀手，鼓动柳姨娘派人去儋州下毒的是他，牛栏街刺杀案的幕后主谋也是她。总而言之，这是一个极其疯狂，而且能量大到皇帝都有点忌惮的恐怖女人。
第三拨就是以庆帝为主，想要利用范闲的势力。庆帝一开始就知道范闲被救到了儋州，但碍于五竹当保镖，所以没法斩草除根。经过十几年观察，庆帝认为范闲并不像叶轻眉那么离经叛道，自己努力一把说不定可以把范闲调教成天下第一权臣，给未来的新皇帝当马仔。
再加上当时长公主在太子和二皇子之间搅和，一会儿给这个递刀子，一会儿给那个挖坑，让庆帝十分不爽。所以庆帝急需一个可以正面刚李云睿的炮灰，于是范闲成为了最佳人选。为了给两人栓对，庆帝指婚林婉儿嫁给范闲，还将内库管理权也过户给了范闲。
李云睿几次刺杀范闲失败，就开始在口碑领域对范闲下手。她勾结北齐文坛大家庄墨韩，在两国和谈晚宴上当众指控范闲抄袭，败坏南庆文坛名声。结果范闲酒后狂背《唐诗三百首》，把一群不认识李白杜甫的土包子吓成了表情包，小范诗仙的威名从此传播出去。
晚宴结束后，范闲跟五竹一起潜入皇宫，偷走了太后寝宫里的黑箱子钥匙，配好一把后原路返还。范闲用钥匙打开黑箱子，喜提神器巴雷特，以及叶轻眉留给五竹的信。
在偷钥匙的途中，范闲无意中撞见李云睿跟庄墨韩的密谈，得知了李云睿勾结北齐，将言冰云出卖的事情。第二天范闲让五竹把李云睿卖国的丑闻写成上千份传单（五竹的字迹没人认识），并且散发到全城。结果捅到庆帝那里，李云睿暂时被流放回信阳，范闲接手内库和跟林婉儿结婚的最大障碍暂时下线。
但赢了李云睿一局的代价，是得到了送肖恩回北齐交换言冰云的S级任务。但也因此得到了陈萍萍正面助攻，组建了以王启年为主的个人团队（高达是悬空寺以后才加入的，电视剧这里改了很多），然后带着北齐皇帝最宠爱的密探司理理，一边调情一边北上交换人质。
出使北齐主要发生了四件大事，第一五竹单挑苦荷，并且故意将范闲身世透露出去，于是苦荷利用自己的宣传渠道，将范闲是叶轻眉之子的事情广播到了各国。
第二跟自己最铁杆的暧昧对象海棠朵朵连线成功，范闲用自己卑鄙无耻的性格，以及比女人还漂亮的盛世美颜成功俘获了海棠朵朵的芳心，为后来得到天一道功法做了铺垫。
第三从肖恩嘴里得到了神庙的秘密，并且正式确认了自己其实是庆帝亲生儿子的秘密。
第四北齐皇帝战豆豆，表面上是男的其实是女的，而且战豆豆还是《红楼梦》跟《范闲诗集》的忠实粉丝，在跟范闲简单交流之后，将其锁定为借种对象，并在海棠朵朵的助攻下，给范闲下了春药成功借种。而范闲直到东夷城跟战豆豆再次大战，之前一直都以为自己跟司理理打了扑克。
从北齐接回言冰云以后，就是第二个S级任务下江南接手内库。临行前范闲陪庆帝去悬空寺祭祀，结果被天下第一刺客影子狙击，范闲霸道真气爆体遭到重创，但也因此得到了庆帝的父爱回馈。而陈萍萍也趁机跟范闲进行了彻底切割，直到后来君臣翻脸庆帝都没有怀疑过范闲。
悬空寺之后庆帝将七个虎卫拨给范闲，高达加入范闲团队，帮助范闲拦截了若干次李云睿的暗杀。
范闲正式下江南，随行的有自己大徒弟三皇子李承平（未来的庆国皇帝）。北齐使者海棠朵朵，海棠给范闲带来了天一道功法，只不过是苦荷自己写的假货。可海棠早就是范闲的女人，于是她私自将正版天一道功法传授给了范闲，自此霸道真气爆体的困扰被彻底解决，但也让范闲永远失去了进入王道境界的机会。
在江南主线任务非常顺利，在叶家老掌柜帮助下一举收编内库，而且范闲还利用自己在北齐的人脉，做起了比李云睿之前规模还大的走私生意。而京城那边又范建这个超级商业天才打掩护，于是庆帝太子等人无论怎么查，都抓不到范闲的小辫子。
江南任务结束后顺道回儋州看奶奶，范闲正式收编了东夷城四顾剑派来的王十三郎，从此范闲团队有了两个九品上的半步宗师级战力。
在回京都途中经过雪山山谷时，范闲被秦家和燕小乙儿子燕慎独刺杀，在范闲跟影子的合力下横扫了所有刺客，燕小乙独生子被王十三郎摘头。而这次事件背后又有陈萍萍在唆使，于是庆帝那边又一次坚信范闲跟自己一条心，陈萍萍这个怀比非要置他于死地。
在范闲还在江南搞事情的时候，京都发生了一件震惊世界的大丑闻。长公主李云睿与太子李承乾乱L，被庆帝查了出来。盛怒之下的庆帝血洗东宫和广信宫，还把长公主又赶出京都，还把太子发配到南诏国，准备让他死在路上。但范闲害怕太子彻底倒台后，庆帝会把枪口对准自己，于是暗中保护了太子，也为后来的京都之乱做了铺垫。
这边闹得如火如荼的时候，范闲抽空第二次下江南，收复了江南大户明家，还收到了来自大宗师叶流云的问候，见识了一剑倾半楼的恐怖战力。
接下来进入整部小说的最高潮——大东山之战，大东山一战是庆帝经过几十年布局的超级大阴谋，选择了一个最佳时机亮牌并且胜出。这个局在庆帝的阴比生涯中，不亚于当年的太平别院血案。
庆帝以大东山祭天废太子之名，带着文武百官登山装比，故意释放给李云睿等人“这是杀朕的最佳时机”。于是李云睿果然中招，一方面联络太子二皇子秦家，在京都举兵造反，宣告庆帝已死，扶持太子登基。另一方面联络跨国际组织君山会，邀约叶流云、苦荷、四顾剑三大宗师登山杀庆帝。
庆帝这边的战力筹备：答应范闲保护庆帝不死的五竹、假宗师洪四庠、真宗师庆帝、最强卧底叶流云。
对面战力：傻乎乎跑来跳坑的四顾剑、苦荷。
由于双方战力严重不对等，外加庆帝一直勾结叶流云，并且隐藏自己的大宗师身份，导致四顾剑苦荷掌握的所有信息都是误导。结果就是四顾剑跟叶流云缠斗，被庆帝从背后用王道一拳打爆半边身体。苦荷杀死洪四庠后发现被骗，结果被庆帝一指度半湖活活撑死，自此两大宗师正式退出历史舞台。
范闲在回京都路上，用巴雷特狙杀了天下第一九品射手燕小乙，但这场战斗也是范闲生平离死亡最近的一次，比后来打庆帝还惊险，有兴趣的可以去看原文，即使后续有电视剧，也绝对拍不出十分之一的效果来。
京都这边，监察院黑骑力顶秦家上万精兵，而且还成功扛了下来。关键时候叶重跟宫典反水，近身偷袭秦业老爷子，在从天而降的范闲帮助下，三人将秦业重创，最后被藏在暗处的影子一剑收割人头，叛军失去主帅，外加庆帝华丽归国，这场叛乱正式收尾。
太子、长公主、二皇子、皇后自杀，太后被范闲用毒药杀死，庆帝带着胜利光环回归时，发现自己竟然鳏寡孤独了，这时候隐隐感觉到自己是被某个人耍了。范闲此时知道陈萍萍的一系列操作，一方面劝陈萍萍收手，另一方面全力迎合庆帝，全面接手监察院，并且上书陈萍萍告老还乡，希望以此保住陈萍萍。
而陈萍萍的计划进入了最后一步，根本不可能收手。在范闲努力保他的时候，陈萍萍却故意设局把范闲支去了东夷城，东夷城四顾剑即将死去，最后将东夷城老百姓托付给范闲，还把自己的剑法也传给了范闲。
在东夷城范闲知道了北齐皇帝是女人的真相，两人在四顾剑的剑庐大战了一个通宵，成功让战豆豆怀上了女儿红豆饭。
范闲在东夷城忙活的时候，陈萍萍在告老还乡路上，被庆帝安排军队拦截，陈萍萍孤身回到京都城，当面戳穿了庆帝杀死叶轻眉的真相（全书最精彩的一段文戏），还用叶轻眉留在轮椅上的霰弹枪把庆帝打了一个满脸花，换来了庆帝凌迟处死的大礼包。
范闲接到王启年的报信，疯了一样赶回京都，但是晚了一步，被割成血人的陈萍萍死在范闲怀里，临终遗言：枪~~~那玩意~~~~~我也有。
陈萍萍死后，庆帝一直在等着范闲进宫给自己一个解释，然后父子两个就可以冰释前嫌。但范闲却用几个月时间做了准备，将京都内库一把火烧了，其他资产和工艺流程记录都搬到了十家村。还把东夷城彻底纳入了自己的掌控之下，范闲让它反就反。江南明家只要一听自己吹哨子，立刻就会把整个南方经济搞垮。北齐跟西凉那边，也随时会响应范闲的计划，几面夹击南庆国。
范闲所做一切，只想换一场跟庆帝的公平决斗。可惜庆帝是大宗师，范闲是九品上，庆帝打范闲跟拍死一只蚊子一样轻松。即使有王十三郎、海棠朵朵、狼桃、何道人、剑庐四子等九品上高手的合力，庆帝也就使出了拍死一群蚊子的力气，轻松将所有人吊打。
后来范若若在摘星楼用巴雷特重创庆帝，救下了范闲一行人，范闲躲到言冰云家里，从密道逃出了南庆国。然后一路向北，找到了北极神庙，发现这就是一座军事博物馆，而且能量就快要用光了。
范闲拒绝了神庙的邀约，跟王十三郎海棠朵朵一起砸坏了神庙电脑，强行带走了五竹。五竹跟随范闲一行人回到京都以后，突然想起了一些过去的事情，他跟着自己记忆的线索找到了皇宫，想起了一个名字“小李子”，而且这个小李子是个超级怀比，不但害死了叶轻眉，还要加害范闲，于是五竹迎着皇宫一万禁军，义无反顾的杀了进去。
庆帝最终被五竹、范闲、范若若+巴雷特耗到油尽灯枯，临死前用最后的霸道真气砍向了五竹脸上的黑布，结果触发了激光眼，庆帝最后的遗言“原来如此，不过如此，依然如此”。
庆帝死后，范闲带着林婉儿、思思以及自己一双儿女隐居西湖，但依旧掌握着足以抗衡新皇帝的庞大势力，以此作为保住家族的根基。
范闲儿女长大后，乘坐宇宙飞船去了外星，开启了《间客》的故事，《间客》故事结尾，范闲回到地球，看到在当年离开的地方，一个瞎子少年坐在那里等他们，